پروتئین ها هنگام حرکت در ژل قابل مشاهده نیستند.برای مشاهده ی آنها از این واقعیت بهره می‌بریم که آنها آنزیم هستند. وقتی سابسترات به ژل اضافه می شود، هر آنزیم واکنش نشان داده و محصول تولید می شود. محصول بوجود آمده معمولاً قابل دیدن نیست.وقتی مواد رنگی به ژل اضافه نمی شود در هر قسمت آن که نودرهای رنگی بوجود آمد نشان دهنده ی حضور آنزیم در آن قسمت است.
ترکیبی از آنزیم های قابل انحلال به یک ژن اضافه می شود. جریان الکتریکی باعث حرکت پروتئین در ژل می شود که سرعت این حرکت بستگی به سایز و شارژ آن دارد.
...
